Search form

Institute for Integrative system biology (I2SysBio)- University of Valencia

Contact details
Traineeship proposition
Abstract
Testimony
Admin

Abstract Bachelor Project FBT 2018-2019Finding a bacteriophage as potential killer for antibiotic-resistant bacteria

There are many diseases that lead to the death of which chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is the third most common one. It is determined that bacteria are possible causative agents for this disease. Bacterial airway infections play a role in many cases of acute exacerbations of chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and can be successfully treated with antibiotics. In some cases, antibiotics are not always the right treatment because emerging bacterial resistant variants arise. Antibiotic-resistant bacteria lead to higher medical costs, prolonged hospital stays and increased mortality. Phage therapy, which uses phages (natural predators of bacteria) to treat bacterial infections can be a potential solution to treat antibiotic-resistant bacteria.

The aim of this bachelor project is to find phages who would be a potential killer for antibiotic- resistant bacteria. Phages can be alternative tools against antibiotic-resistant bacteria. The project focuses on Klebsiella pneumoniae as a pathogenic bacteria relevant in COPD. Escherichia coli and Mycobacterium smegmatis are going to be used here as controls for detection of environmental phages.

New phages are searched around Valencia in Spain. Phages are sought especially near hospitals, sometimes in sewers and close to water recycling systems. At these places, there is the best chance to find phages for K. pneumoniae. After collecting the sample (including the potential phage) different tests are carried out. Phage hunting was done sixth times, but didn’t always give positive results. Potential phages were found from the first and the third time phage hunting. In total, six lytic phages have been found who can kill a clinical strain of K. pneumoniae.

In the future, phages found in this project will be further characterized by transmission electron microscopy (TEM) and next-generation sequencing to provide more insight about the novelty of these phages. In addition, experimental evolution will be done in order to obtained improved phages, more lytic, or with increased host range, that will be potential tools against COPD involved bacteria.

Address

C/Catedrático Agustín Escardino, 9 ,
46980 Paterna
Spain

Contacts

Traineeship supervisor
Pilar Domingo-Calap
pilar.domingo@uv.es

Testimony Justine Vienne

Valencia als derde grootste stad van Spanje heeft heel wat te bieden. Een snuifje cultuur, de zon, straatfeesten en zelfs verbranden op het strand hoort er allemaal bij. Genieten van de natuur zoals Jardin del Turia met de nodige vitamine D. Je kan je buikje rond eten in Mercat Central of eens de echte Paella (Paella Valenciana) uitproberen aan het strand. Heerlijke tapas is hier zeker ook te vinden. Heb je nu eenmaal dorst dan kan je Aqua de Valencia of Horchata uitproberen. Horchata is gemaakt van ‘chufas’, een soort aardamandel en is specifiek voor Valencia. Indien je wat meer cultuur wenst, is een bezoekje aan ‘ciutat de les arts i les ciències’ een aanrader als herkenningspunt van deze mooie stad. Indien je in maart komt, raad ik zeker het feest ‘Fallas’ aan. De Fallas was soms een nadeel aangezien het een week feesten is en je nergens rust kon vinden. Slapen is zeer moeilijk gedurende deze periode. Weken kan je in Valencia vertoeven aangezien het een studentenstad is met veel Erasmusstudenten, maar natuurlijk ook Spaanse studenten. Ook naast Valencia zijn er zeer mooie steden te bezoeken. Treinverbinding is ideaal om een dagje Madrid of Barcelona te doen.

Op mijn stageplaats wordt er vooral gewerkt met bacteriën, virussen en cellen. Met een budget van drie miljoen euro kan er hier aan verschillende projecten worden gewerkt. Mijn onderzoek was een volledig nieuw project dat ze gestart hebben met resultaat. In het labo wordt er vooral manueel en microbiologisch gewerkt. De collega’s zijn zeer vriendelijk en behulpzaam en staan altijd voor u klaar. Mijn accommodatie was 25 minuten verwijderd van het labo. De verbinding met de metro was ideaal. De prijs voor een accommodatie is hier goedkoper dan in België. Als u echter voor het centrum kiest, blijft de prijs hetzelfde. Ik betaalde 375 euro als huurprijs. Mijn kamer bevond zich dicht aan het centrum en ik heb geen nadelen ondervonden . Het voordeel is dat je wel in contact komt met internationale studenten wat wel leuk is.

Je kan snel een accommodatie vinden voor 250 euro per persoon als je dat wilt, maar dan zal dit niet dicht bij het centrum zijn. Qua eten en drinken is het redelijk wat goedkoper dan in België wat ook wel handig is. Het enige contra dat ik ondervind, is het werken voor school. Ik ging ook op Spaanse les en betaalde hiervoor 350 euro gedurende de vier maanden. Het is een aanrader als je snel wilt Spaans bijleren.

Weblog: https://justinevienne.wixsite.com/valencia 

Zoekopdracht
Klassiek
Via Map